JICA situa o Brasil como seu parceiro global na solução de questões mundiais e realiza cooperação que contribui não só para a solução de problemas internos do Brasil, mas também, de questões mundiais.
Para com o Brasil, país que vem contribuindo ativamente na questão ambiental em escala global e é uma das principais potências econômicas mundiais, a JICA estipulou como um dos desafios a questão ambiental. Nesse sentido, a JICA vem atuando no fortalecimento das medidas contra mudanças climáticas por meio da preservação do ecossistema / uso sustentável dos recursos naturais (preservação da Floresta Amazônica, aumento da produção de biocombustíveis, etc.) e no enfrentamento dos crescentes problemas de meio ambiente urbano, tais como poluição atmosférica causada por congestionamentos ou poluição da água.
Com relação ao desenvolvimento social, vem realizando cooperação visando a redução da desigualdade através de ações de desenvolvimento da infraestrutura sócio-econômica nas regiões norte, nordeste e centro-oeste, de assistência agrícola e irrigação nos cerrados e caatinga (semi-árido), e de desenvolvimento da infraestrutura básica nos centros urbanos (saúde, saneamento, segurança, transporte, etc.).
A JICA também promove a cooperação tripartite, pela qual se aproveitam os recursos e o know-how que o Brasil e o Japão detêm para prestar assistência a um outro país em desenvolvimento. Em 2000 os dois governos celebraram um convênio chamado “Programa de Parceria Brasil-Japão (JBPP)”, para promover ainda mais a cooperação tripartite. Como parceiros nas questões de escala mundial, focados na América Latina e nos países africanos de língua portuguesa, o Brasil e o Japão vêm promovendo a cooperação em áreas como agricultura, saúde e serviço médico, meio ambiente e formação profissional.