En 1973, se firmó un convenio de envío de voluntarios japoneses entre los gobiernos de Japón y Costa Rica, ratificando bajo la Ley N°6938. Esto permitió la llegada del primer grupo de los voluntarios japoneses para la Cooperación con el Extranjero el 9 de octubre de 1974. El 06 de mayo de 1986 se aprobó la Ley N°7036 de cooperación técnica, que permitió al país recibir programas de cooperación técnica, envió de expertos japoneses, envió de becarios a Japón y todas las otras modalidades que JICA ofrece.
Desde el 2008, y en vista del enfoque orientado a la realidad local que JICA adopta en cada país, las actividades en conjunto con el Gobierno de Costa Rica, se han concentrado en tres áreas prioritarias: