En los países en vías de desarrollo, se pierden muchas vidas y propiedades en caso de grandes desastres tales como terremotos, erupciones volcánicas, tifones, inundaciones, incendios, etc., no sólo durante el siniestro, sino también posteriormente debido a la falta de recursos y la infraestructura inadecuada en los lugares afectados, lo cual hace difícil tomar medidas urgentes para el auxilio y la restauración en estos lugares.
En estos casos, el Gobierno del Japón, a través de JICA, provee ayuda de auxilio mediante el envío de equipos médicos y expertos, y el suministro de materiales de auxilio, a solicitud de los países afectados por los desastres y/o de las organizaciones internacionales. Con este propósito, JICA envía el Equipo Japonés de Auxilio para Desastres (JDR), compuesto por equipos de rescate, de atención médica y de otros expertos, en combinaciones adecuadas de personal, según el tipo y la magnitud del desastre. El JDR realiza actividades de búsqueda y rescate, actividades de atención médica de emergencia, medidas preventivas de emergencia y actividades de restauración.
En abril del año 1991, el Gobierno del Japón ofreció este tipo de ayuda a Panamá cuando ocurrió el terremoto en la provincia de Bocas del Toro, mediante una donación de suministros de emergencia por un valor de B/.125,000.00. Asimismo, en diciembre de 1993, se donaron 2,250 frazadas para los afectados por la fuertes inundaciones que afectaron varias poblaciones en Bocas del Toro. Igualmente, en diciembre de 1996, se donaron colchonetas y casas de campañas a los damnificados de las inundaciones ocurridas en algunas áreas de la provincia de Colón y la Comarca Kuna Yala, valoradas en más de 37 mil dólares. En octubre de 2000, se donaron colchonetas y frazadas, valoradas en B/.18,320, para ser distribuidas a los damnificados de las inundaciones ocurridas en la provincia de Chiriquí. Asimismo, se hicieron donaciones similares durante las inundaciones de Colón, Kuna Yala y Panamá Oeste en Noviembre de 2006, y más recientemente en las inundaciones de Bocas del Toro y Chiriquí en Diciembre de 2008.