En la actualidad JICA coopera con Colombia en las siguientes áreas prioritarias consensuadas en reuniones con el Ministerio de Relaciones Exteriores de Colombia, la Embajada del Japón en Colombia y la Agencia Colombiana de Cooperación Internacional ACCI:
Primera área prioritaria: Contribución para la construcción de la paz.
Cuyo objetivo es: Brindar asistencia a las personas más vulnerables fortaleciendo la seguridad humana. Esta área está conformada por dos programas:
- Programa de asistencia a población vulnerable y desplazamiento.
- Programa de mejoramiento de la calidad de vida en las ciudades regionales y las zonas rurales.
Segunda área prioritaria: Desarrollo social y construcción de la equidad social.
El objetivo de esta área es: Mejorar la capacidad administrativa en el nivel regional. Diversificar los productos, mejorar la productividad y proveer asistencia para construir infraestructura social.
Los programas que conforman esta segunda área son:
- Programa de planeación urbana.
- Programa de fortalecimiento de la prevención de desastres.
Tercera área prioritaria: Desarrollo económico sostenible y promoción de la generación de empleo. Objetivo: Apoyar técnicamente el mejoramiento del control de calidad y asistencia para del desarrollo tecnológico.
El programa de la tercera área prioritaria, es:
- Programa de fomento para la Mediana y Pequeña Industria (MYPIMES) y mejoramiento de la productividad.
Cuarta y última área prioritaria: Medio Ambiente.
Objetivo: Brindar asistencia para generar una adecuada disposición de residuos, fortalecimiento de la educación a la comunidad, fortalecer la conservación y aprovechamiento sostenible del medio ambiente, tales como bosques. Asistencia técnica a las medidas para la conservación de ecosistemas. Sus programas son:
- Programa de conservación del medio ambiente urbano.
- Programa de conservación del medio ambiente natural.